追記（12/24）：これでうまく動いたと思ってたんですが、まだRmarkdownではうまくグラフ描けないようです。。すみません。 追記（12/26）：YAMLで指定するのをd3.jsではなくd3.min.jsに変えれば動くことが分かりました（.minもBowerがダウンロードしてくれて…